Ukr.Biochem.J. 2022; Том 94, № 5, вересень-жовтень, c. 84-96
doi: https://doi.org/10.15407/ubj94.05.084
Убіквітин та його роль у протеолізі: нобелівська премія з хімії у 2004 році
О. П. Матишевська, В. М. Данилова, М. В. Григор’єва, С. В. Комісаренко
Інститут ім. О. В. Палладіна НАН України, Київ;
e-mail: matysh@yahoo.com
Отримано: 11 листопада 2022; Виправлено: 29 вересня 2022;
Затверджено: 04 листопада 2022; Доступно онлайн: 19 грудня 2022
Аарон Чехановер, Аврам Гершко та Ірвін Роуз на початку 1980-х років відкрили один з найважливіших циклічних процесів у клітині – регульовану АТР-залежну деградацію протеїнів, за що було нагороджено Нобелівською премією з хімії у 2004 році. Вчені довели існування нелізосомного шляху протеолізу і повністю змінили уявлення про механізми деградації протеїнів усередині клітини. Вони продемонстрували, що, обираючи протеїн, який підлягає знищенню, клітина попередньо позначає його біохімічним маркером під назвою убіквітин. Поліубквітування протеїну як сигнал для його протеолізу було новим механізмом, розкриття якого уможливила спільна робота трьох учених із виділення ензимів–учасників цього послідовного процесу, з’ясування його біохімічних етапів та причин енергозалежності. У статті наведено біографічні дані Нобелівських лауреатів, описано застосовані методи та історію відкриття феномену опосередкованої убіквітином протеосомної деградації протеїнів.
Ключові слова: PROTAC, І. Роуз, А. Гершко, А. Чехановер, регульована деградація протеїнів, убіквітин
Посилання:
- Avram Hershko – Biographical. Regime of access : https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2004/hershko/biographical/
- Hershko A, Tomkins GM. Studies on the degradation of tyrosine aminotransferase in hepatoma cells in culture. Influence of the composition of the medium and adenosine triphosphate dependence. J Biol Chem. 1971;246(3):710-714. PubMed
- Etlinger JD, Goldberg AL. A soluble ATP-dependent proteolytic system responsible for the degradation of abnormal proteins in reticulocytes. Proc Natl Acad Sci USA. 1977;74(1):54-58. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Sudakin V, Ganoth D, Dahan A, Heller H, Hershko J, Luca FC, Ruderman JV, Hershko A. The cyclosome, a large complex containing cyclin-selective ubiquitin ligase activity, targets cyclins for destruction at the end of mitosis. Mol Biol Cell. 1995;6(2):185-197. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Rose IA, Schweigert BS. Effect of vitamin B12 on nucleic acid metabolism of the rat. Proc Soc Exp Biol Med. 1952;79(3):541-544. PubMed, CrossRef
- Rose IA, Schweigert BS. Incorporation of C14 totally labeled nucleosides into nucleic acids. J Biol Chem. 1953;202(2):635-645. PubMed
- Haas AL, Murphy KE, Bright PM. The inactivation of ubiquitin accounts for the inability to demonstrate ATP, ubiquitin-dependent proteolysis in liver extracts. J Biol Chem. 1985;260(8):4694-4703. PubMed
- Rose IA, O’Connell EL, Litwin S. Determination of the rate of hexokinase-glucose dissociation by the isotope-trapping method. J Biol Chem. 1974;249(16):5163-5168. PubMed
- Ciehanover A, Hod Y, Hershko A. A heat-stable polypeptide component of an ATP-dependent proteolytic system from reticulocytes. Biochem Biophys Res Commun. 1978;81(4):1100-1105. PubMed, CrossRef
- Aaron Ciechanover. Regime of access : https://uk.wikipedia.org/wiki/
- Ciechanover A, Heller H, Elias S, Haas AL, Hershko A. ATP-dependent conjugation of reticulocyte proteins with the polypeptide required for protein degradation. Proc Natl Acad Sci USA. 1980;77(3):1365-1368. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Hershko A, Ciechanover A, Heller H, Haas AL, Rose IA. Proposed role of ATP in protein breakdown: conjugation of protein with multiple chains of the polypeptide of ATP-dependent proteolysis. Proc Natl Acad Sci USA. 1980;77(4):1783-1786. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Goldknopf IL, Busch H. Isopeptide linkage between nonhistone and histone 2A polypeptides of chromosomal conjugate-protein A24. Proc Natl Acad Sci USA. 1977;74(3):864-868. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Ciechanover A, Elias S, Heller H, Ferber S, Hershko A. Characterization of the heat-stable polypeptide of the ATP-dependent proteolytic system from reticulocytes. J Biol Chem. 1980;255(16):7525-7528. PubMed
- Wilkinson KD, Urban MK, Haas AL. Ubiquitin is the ATP-dependent proteolysis factor I of rabbit reticulocytes. J Biol Chem. 1980;255(16):7529-7532. PubMed
- Goldstein G. Isolation of bovine thymin: a polypeptide hormone of the thymus. Nature. 1974;247(5435):11-14. PubMed, CrossRef
- Popular information. Regime of access : https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2004/popular-information/
- Ciechanover A, Elias S, Heller H, Hershko A. “Covalent affinity” purification of ubiquitin-activating enzyme. J Biol Chem. 1982;257(5):2537-2542. PubMed
- Hershko A, Heller H, Elias S, Ciechanover A. Components of ubiquitin-protein ligase system. Resolution, affinity purification, and role in protein breakdown. J Biol Chem. 1983;258(13):8206-8214. PubMed
- Ciechanover A. The ubiquitin-proteasome pathway: on protein death and cell life. EMBO J. 1998;17(24):7151-7160. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Haas AL, Rose IA. The mechanism of ubiquitin activating enzyme. A kinetic and equilibrium analysis. J Biol Chem. 1982;257(17):10329-10337. PubMed
- Hershko A, Heller H, Eytan E, Reiss Y. The protein substrate binding site of the ubiquitin-protein ligase system. J Biol Chem. 1986;261(26):11992-11999. PubMed
- Hershko A, Leshinsky E, Ganoth D, Heller H. ATP-dependent degradation of ubiquitin-protein conjugates. Proc Natl Acad Sci USA. 1984;81(6):1619-1623. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Waxman L, Fagan JM, Goldberg AL. Demonstration of two distinct high molecular weight proteases in rabbit reticulocytes, one of which degrades ubiquitin conjugates. J Biol Chem. 1987;262(6):2451-2457. PubMed
- Hoffman L, Pratt G, Rechsteiner M. Multiple forms of the 20 S multicatalytic and the 26 S ubiquitin/ATP-dependent proteases from rabbit reticulocyte lysate. J Biol Chem. 1992;267(31):22362-22368. PubMed
- Regime of access : https://www.caltagmedsystems.co.uk/
- Glickman MH, Ciechanover A. The ubiquitin-proteasome proteolytic pathway: destruction for the sake of construction. Physiol Rev. 2002;82(2):373-428. PubMed, CrossRef
- Sakamoto KM. Ubiquitin-dependent proteolysis: its role in human diseases and the design of therapeutic strategies. Mol Genet Metab. 2002;77(1-2):44-56. PubMed, CrossRef
- Ito T, Ando H, Suzuki T, Ogura T, Hotta K, Imamura Y, Yamaguchi Y, Handa H. Identification of a primary target of thalidomide teratogenicity. Science. 2010;327(5971):1345-1350. PubMed, CrossRef
- Stewart AK. Medicine. How thalidomide works against cancer. Science. 2014;343(6168):256-257. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Sakamoto KM, Kim KB, Kumagai A, Mercurio F, Crews CM, Deshaies RJ. Protacs: chimeric molecules that target proteins to the Skp1-Cullin-F box complex for ubiquitination and degradation. Proc Natl Acad Sci USA. 2001;98(15):8554-8559. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Guedeney N, Cornu M, Schwalen F, Kieffer C, Voisin-Chiret AS. PROTAC technology: A new drug design for chemical biology with many challenges in drug discovery. Drug Discov Today. 2022;28(1):103395. PubMed, CrossRef
