Е. Луговськой¹ , М. Пидюра², Є. Макогоненко¹*, Л. Урвант¹,
П. Гриценко¹, І. Колеснікова¹, Н. Луговська¹, С. Комісаренко¹

¹Інститут біохімії ім. О. В. Палладіна НАН України, Київ;
²Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України, Київ;
*e-mail: ymakogonenko@gmail.com

Отримано: 19 травня 2020; Затверджено: 30 червня 2020

Раніше ми показали, що в процесі перетворення фібриногену людини у фібрин на фрагменті Bβ119-133, який розташований у шарнірний ділянці молекули, експонується нео­антигенна детермінанта. Фібринспецифічне mAb FnI-3c та його Fab-фрагмент, епітоп для яких знаходиться в цьому фрагменті, гальмують латеральну асоціацію протофібрил. Ми припустили, що епітоп співпадає із сайтом, який бере участь у цьому процесі. У цій роботі ми більш точно визначили розташування епітопу для mAb FnI-3c у молекулі фібрину та встановили його роль у функціонуванні шарнірного локусу молекули. Було виявлено, що mAb FnI-3c зв’язується з фібрином людини, коня та кроля, які мають лізин у положенні, що відповідає такому BβK130 фібрину людини, але відсутній у фібрині бика та щура, у яких в цьому положенні є інші амінокислотні залишки, що вказує на те, що залишок BβK130 є невід’ємною складовою  епітопу. Цей факт, дані гомології та структурно-біологічний аналіз амінокислотних послідовностей навколо BβK130 свідчать про те, що досліджуваний сайт локалізований у межах Bβ125-135 молекули фібрину. Синтетичні пептиди Bβ125-135 та Bβ121-138, на відміну від їхніх неупорядкованих аналогів, зв’язуються з FnI-3c в ППР аналізі. Обидва пептиди на відміну від їхніх неупорядкованих версій, інгібували латеральну асоціацію протофібрил. Епітоп mAb FnI-3c експонується після відщеплення фібринопептиду А та утворення мономеру desA фібрину. Структурний біологічний аналіз переходу фібриногену у фібрин показав чітке підвищення рухливості в шарнірному локусі. Ми вважаємо, що така структурна перебудова в шарнірних областях фібрину спричинює формування конформації молекули, яка необхідна для латеральної асоціації протофібрил фібрину.