Ukr.Biochem.J. 2014; Том 86, №4, липень-серпень, c. 119-125

doi: http://dx.doi.org/10.15407/ubj86.04.119

Інгібування полімеризації фібрину синтетичними пептидами, які відповідають ділянкам Аα195-205 і γ69-77 молекули фібрину

23.06.2015   Без категорії   No comments

Т. А. Позняк, Л. П. Урвант, П. Г. Гриценко, В. І. Чернишов,
М. О. Пидюра, Е. В. Луговськой, C. B. Комісаренко

Інститут біохімії ім. О. В. Палладіна НАН України, Київ;
e-mail: lougovskoy@yahoo.com

За використання принципу «пролінових скоб» в амінокислотній послідовності фібрину виявлено чотири ділянки та синтезовано відповідні їм пептиди: γ69NPDESSKPN77, Bβ228QPDSSVKPY236, Bβ455RPFFPQ460 та Aα195LPSRDRQHLPL205. Методами турбідиметричного аналізу та електронної мікроскопії показано, що синтетичний пептид Аα195-205 специфічно інгібує стадію формування протофібрил фібрину, а пептид γ69-77 – ста­дію латеральної асоціації протофібрил. Одержані результати дозволяють припустити, що в досліджуваних амінокислотних послідовностях фібрину розташовані сайти, які беруть участь у процесах полімеризації.

Ключові слова: , , ,

Посилання:

  1.  Averett LE, Schoenfisch MH, Akhremitchev BB, Gorkun OV. Kinetics of the multistep rupture of fibrin ‘A-a’ polymerization interactions measured using atomic force microscopy. Biophys J. 2009 Nov 18;97(10):2820-8. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
  2. Fowler WE, Hantgan RR, Hermans J, Erickson HP. Structure of the fibrin protofibril. Proc Natl Acad Sci USA. 1981 Aug;78(8):4872-6. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
  3. Weisel JW, Veklich Y, Gorkun O. The sequence of cleavage of fibrinopeptides from fibrinogen is important for protofibril formation and enhancement of lateral aggregation in fibrin clots. J Mol Biol. 1993 Jul 5;232(1):285-97. PubMed, CrossRef
  4. Kini RM, Evans HJ. A hypothetical structural role for proline residues in the flanking segments of protein-protein interaction sites. Biochem Biophys Res Commun. 1995 Jul 26;212(3):1115-24. PubMed, CrossRef
  5. Kini RM, Evans HJ. A common structural feature enclosing interaction sites: Prediction of protein-protein interaction sites and development of potent bioactive peptides. Toxicon. 1995 Nov;33(11):1400-1401.  CrossRef
  6. Kini RM. Proline brackets and identification of potential functional sites in proteins: toxins to therapeutics. Toxicon. 1998 Nov;36(11):1659-70. PubMed, CrossRef
  7. Kini RM, Evans HJ. Prediction of potential protein-protein interaction sites from amino acid sequence. Identification of a fibrin polymerization site. FEBS Lett. 1996 Apr 29;385(1-2):81-6. PubMed, CrossRef
  8. Cierniewski CS, Budzynski AZ. Involvement of the alpha chain in fibrin clot formation. Effect of monoclonal antibodies. Biochemistry. 1992 May 5;31(17):4248-53. PubMed, CrossRef
  9. Lugovskoy E, Gritsenko PG, Kapustia­nenko LG, Kolesnikova IN, Chernishov VI, Komisarenko SV. Functional role of Bbeta-chain N-terminal fragment in the fibrin polymerization process. FEBS J.  2007 Sep;274(17):4540–9. PubMed,  CrossRef
  10. Varetskaya TV. Microheterogeneity of fibri­nogen. Cryofibrinogen. Ukr Biokhim Zhurn. 1960;32(1):13–24. (In Ukrainian).
  11. Lougovskoi EV, Gogolinskaya GK. Preparation of fibrin des-AA by thrombin. Ukr Biokhim Zhurn. 1999;71(4):107–8. (In Russian). PubMed
  12. Belitser VA, Varetskaja TV, Malneva GV. Fibrinogen-fibrin interaction. Biochim Biophys Acta. 1968 Feb 19;154(2):367-75. PubMed, CrossRef
  13. Williams RC. Band patterns seen by electron microscopy in ordered arrays of bovine and human fibrinogen and fibrin after negative staining. Proc Natl Acad Sci USA. 1983 Mar;80(6):1570-3. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
  14. Gorkun OV, Henschen-Edman AH, Ping LF, Lord ST. Analysis of A alpha 251 fibrinogen: the alpha C domain has a role in polymerization, albeit more subtle than anticipated from the analogous proteolytic fragment X. Biochemistry. 1998 Nov 3;37(44):15434-41. PubMed, CrossRef
  15. Urvant LP, Makogonenko EM, Pydura NA, Kolesnikova IN, Lugovskaya NE, Lugovskoi EV, Komisarenko SV. Localization of epitope of fibrin specific monoclonal antibody I-3c within Вβ118-134 fragment of human fibrin. Reports of the National Academy of Science of Ukraine. 2013;(10):170–175. (In Ukrainian).
  16. Jing P, Rudra JS, Herr AB, Collier JH. Self-assembling peptide-polymer hydrogels designed from the coiled coil region of fibrin. Biomacromolecules. 2008 Sep;9(9):2438-46. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
Creative CommonsThis work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.