А. Г. Пономарьова¹, Є. П. Юренко^1,2,3,
Р. О. Жураківський^1,2, Д. М. Говорун^1,2,3

¹Інститут молекулярної біології та генетики НАН України, Київ;
e-mail: yevgen.yurenko@gmail.com;
²Науковий та освітній центр «Державна ключова лабораторія молекулярної
та клітинної біології», Київ, Україна;
³Київський національний університет імені Тараса Шевченка,
Інститут високих технологій, Україна;
e-mail: dhovorun@imbg.org.ua

Вперше на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено повний конформаційний аналіз 2′,3′-дидегідро-2′,3′-дидезоксиагуанозину (d4G), біологічно активного нуклеозиду – інгібітора ВІЛ-зворотної транскриптази (ЗТ). Представлено основні геометричні, енергетичні та полярні характеристики знайдених 20 конформерів, а також основні конформаційні рівноваги за нормальних умов. Встановлено, що d4G стабілізується дев’ятьма типами внутрішньомолекулярних специфічних зв’язків: O5′H…N3, O5′H…C8, C8H…O5′, C2′H…N3, C5′H1…N3, C5′H2…N3, C8H…H1′C5′, C8H…H2′C5′ та N2H1…O5′. Одержані результати підтверджують, що біологічна активність d4G пов’язана з термінацією синтезу полінуклеотидного ланцюга у напрямку 5′-3′ шляхом конкуренції з канонічним 2′-дезоксигуанозином за зв’язування із активним центром ензиму.

Ключові слова: 2′-3′-дидегідро-2′-3′-дидезоксигуанозин, біологічна активність, водневі зв’язки, квантово-хімічні розрахунки, конформаційний аналіз