Ukr.Biochem.J. 2014; Том 86, №3, травень-червень, c. 77-87
doi: http://dx.doi.org/10.15407/ubj86.03.077
Роль Т-домену дифтерійного токсину у внутрішньоклітинному транспортуванні токсинвмісних везикул
А. Ю. Лабинцев, Д. В. Колибо, Є. С. Юрченко,
А. А. Кабернюк, Н. В. Короткевич, С. В. Комісаренко
Інститут біохімії ім. О. В. Палладіна НАН України, Кїв;
е-mail: lab.andrey@gmail.com
Субодиниця В дифтерійного токсину (ДТ), яка складається із двох доменів, R – рецепторного та Т – трансмембранного, відіграє важливу роль у зв’язуванні токсину з рецептором на клітинах-мішенях та у транспортуванні каталітичної субодиниці А до цитозолю. Рекомбінантні аналоги субодиниці В є перспективними представниками унікального класу транспортувальних протеїнів, які здатні забезпечити доставку біологічно активних молекул до цитозолю клітин. Створення таких конструкцій вимагає з’ясування ролі кожного із фрагментів ДТ у транспортуванні комплексу рецептор–токсин.
У роботі досліджували роль Т-домену у внутрішньоклітинному транспортуванні рекомбінантних фрагментів ДТ. Для цього порівнювали особливості внутрішньоклітинного транспортування R-домену та субодиниці В, яка містить в собі як R-, так і Т-домен. Рекомбінантні фрагменти ДТ мітили флуоресцентними протеїнами, що дозволило використовувати в дослідженні техніку колокалізації. Методом конфокальної мікроскопії встановлено відмінності у транспортуванні рекомбінантних похідних ДТ у клітинах лінії Vero. Показано, що R-домен швидше потрапляє до тубулярних компартментів клітини, ніж субодиниця В. Аналіз колокалізації R-домену та субодиниці В підтверджує майже лінійне її зростання за коефіцієнтом Пірсона (PCC) у разі збільшення часу інкубації. Проте відсоток субодиниці В, колокалізованої з R-доменом, визначений за коефіцієнтом Мандерса (M1), зростає нелінійно, що може свідчити про здатність субодиниці В потрапляти до певних компартментів клітини, недоступних для R-домену. Роль Т-домену у внутрішньоклітинному транспортуванні та компартменталізації токсину, вірогідно, пов’язана з його здатністю до формування протонних каналів та взаємодії з комплексом протеїнів цитоплазми COPI.
Ключові слова: внутрішньоклітинне транспортування., дифтерійний токсин, ендоцитоз, конфокальна мікроскопія, Т-домен дифтерійного токсину, флуоресцентні протеїни
Посилання:
- Romaniuk SI, Kolibo DB, Komisarenko SV. Perspectives of application of recombinant diphtheria toxin derivatives. Bioorg Khim. 2012 Nov-Dec;38(6):639-52. Review. Russian. PubMed
- Kolybo DV, Labyntsev AA, Romaniuk SI, Kaberniuk AA, Oliinyk OM, Korotkevich NV, Komisarenko SV. Immunobiology of diphtheria. Recent approaches for the prevention, diagnosis, and treatment of disease. Biotechnol. Acta. 2013;6(4):43–62. CrossRef
- Gordon VM, Klimpel KR, Arora N, Henderson MA, Leppla SH. Proteolytic activation of bacterial toxins by eukaryotic cells is performed by furin and by additional cellular proteases. Infect Immun. 1995 Jan;63(1):82-7. PubMed, PubMedCentral
- Gordon VM, Rehemtulla A, Leppla SH. A role for PACE4 in the proteolytic activation of anthrax toxin protective antigen. Infect Immun. 1997 Aug;65(8):3370-5. PubMed, PubMedCentral
- Sucic JF, Moehring JM, Inocencio NM, Luchini JW, Moehring TJ. Endoprotease PACE4 is Ca2+-dependent and temperature-sensitive and can partly rescue the phenotype of a furin-deficient cell strain. Biochem J. 1999 May 1;339 ( Pt 3):639-47. PubMed, PubMedCentral
- Gordon VM, Leppla SH. Proteolytic activation of bacterial toxins: role of bacterial and host cell proteases. Infect Immun. 1994 Feb;62(2):333-40. Review. PubMed, PubMedCentral
- Tsuneoka M, Nakayama K, Hatsuzawa K, Komada M, Kitamura N, Mekada E. Evidence for involvement of furin in cleavage and activation of diphtheria toxin. J Biol Chem. 1993 Dec 15;268(35):26461-5. PubMed
- Ratts R, Zeng H, Berg EA, Blue C, McComb ME, Costello CE, vanderSpek JC, Murphy JR. The cytosolic entry of diphtheria toxin catalytic domain requires a host cell cytosolic translocation factor complex. J Cell Biol. 2003 Mar 31;160(7):1139-50. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Choe S, Bennett MJ, Fujii G, Curmi PM, Kantardjieff KA, Collier RJ, Eisenberg D. The crystal structure of diphtheria toxin. Nature. 1992 May 21;357(6375):216-22. PubMed
- Rolf JM, Gaudin HM, Eidels L. Localization of the diphtheria toxin receptor-binding domain to the carboxyl-terminal Mr approximately 6000 region of the toxin. J Biol Chem. 1990 May 5;265(13):7331-7. PubMed
- Higashiyama S, Abraham JA, Miller J, Fiddes JC, Klagsbrun M. A heparin-binding growth factor secreted by macrophage-like cells that is related to EGF. Science. 1991 Feb 22;251(4996):936-9. PubMed, CrossRef
- Higashiyama S, Lau K, Besner GE, Abraham JA, Klagsbrun M. Structure of heparin-binding EGF-like growth factor. Multiple forms, primary structure, and glycosylation of the mature protein. J Biol Chem. 1992 Mar 25;267(9):6205-12. PubMed
- Naglich JG, Metherall JE, Russell DW, Eidels L. Expression cloning of a diphtheria toxin receptor: identity with a heparin-binding EGF-like growth factor precursor. Cell. 1992 Jun 12;69(6):1051-61. PubMed
- Zdanovskiy AG, Zdanovskaya MV, Yankovskiy NK. Structure and function of diphtheria toxin. Mol Genet Microbiol Virol. 1988;12:3-10.
- Morris RE, Gerstein AS, Bonventre PF, Saelinger CB. Receptor-mediated entry of diphtheria toxin into monkey kidney (Vero) cells: electron microscopic evaluation. Infect Immun. 1985 Dec;50(3):721-7. PubMed, PubMedCentral
- Senzel L, Huynh PD, Jakes KS, Collier RJ, Finkelstein A. The diphtheria toxin channel-forming T domain translocates its own NH2-terminal region across planar bilayers. J Gen Physiol. 1998 Sep;112(3):317-24. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Oh KJ, Senzel L, Collier RJ, Finkelstein A. Translocation of the catalytic domain of diphtheria toxin across planar phospholipid bilayers by its own T domain. Proc Natl Acad Sci USA. 1999 Jul 20;96(15):8467-70. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Lanzrein M, Sand O, Olsnes S. GPI-anchored diphtheria toxin receptor allows membrane translocation of the toxin without detectable ion channel activity. EMBO J. 1996 Feb 15;15(4):725-34. PubMed, PubMedCentral
- Takahashi T, Umata T, Mekada E. Extension of juxtamembrane domain of diphtheria toxin receptor arrests translocation of diphtheria toxin fragment A into cytosol. Biochem Biophys Res Commun. 2001 Mar 2;281(3):690-6. PubMed, CrossRef
- Quertenmont P, Wolff C, Wattiez R, Vander Borght P, Falmagne P, Ruysschaert JM, Cabiaux V. Structure and topology of diphtheria toxin R domain in lipid membranes. Biochemistry. 1999 Jan 12;38(2):660-6. PubMed, CrossRef
- Lory S, Carroll SF, Collier RJ. Ligand interactions of diphtheria toxin. II. Relationships between the NAD site and the P site. J Biol Chem. 1980 Dec 25;255(24):12016-9. PubMed
- Ren J, Kachel K, Kim H, Malenbaum SE, Collier RJ, London E. Interaction of diphtheria toxin T domain with molten globule-like proteins and its implications for translocation. Science. 1999 May 7;284(5416):955-7. PubMed, CrossRef
- Hammond K, Caputo GA, London E. Interaction of the membrane-inserted diphtheria toxin T domain with peptides and its possible implications for chaperone-like T domain behavior. Biochemistry. 2002 Mar 5;41(9):3243-53. PubMed, CrossRef
- Wang Y, Kachel K, Pablo L, London E. Use of Trp mutations to evaluate the conformational behavior and membrane insertion of A and B chains in whole diphtheria toxin. Biochemistry. 1997 Dec 23;36(51):16300-8. PubMed, CrossRef
- Kaberniuk AA, Labyntsev AIu, Kolybo DV, Oliinyk OS, Redchuk TA, Korotkevych NV, Horchev VF, Karakhim SO, Komisarenko SV. Fluorescent derivatives of diphtheria toxin subunit B and their interaction with Vero cells. Ukr Biokhim Zhurn. 2009 Jan-Feb;81(1):67–77. Ukrainian. PubMed
- Schägger H, von Jagow G. Tricine-sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis for the separation of proteins in the range from 1 to 100 kDa. Anal Biochem. 1987 Nov 1;166(2):368-79. PubMed, CrossRef
- Yasumura Y, Kawakita Y. A line of cells derived from African green monkey kidney. Nippon Rinsho. 1963;21:1209-1210.
- Schindelin J, Arganda-Carreras I, Frise E, Kaynig V, Longair M, Pietzsch T, Preibisch S, Rueden C, Saalfeld S, Schmid B, Tinevez JY, White DJ, Hartenstein V, Eliceiri K, Tomancak P, Cardona A. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):676-82. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Bolte S, Cordelières FP. A guided tour into subcellular colocalization analysis in light microscopy. J Microsc. 2006 Dec;224(Pt 3):213-32. PubMed, CrossRef
- Dunn KW, Kamocka MM, McDonald JH. A practical guide to evaluating colocalization in biological microscopy. Am J Physiol Cell Physiol. 2011 Apr;300(4):C723-42. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Trujillo C, Taylor-Parker J, Harrison R, Murphy JR. Essential lysine residues within transmembrane helix 1 of diphtheria toxin facilitate COPI binding and catalytic domain entry. Mol Microbiol. 2010 May;76(4):1010-9. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Aniento F, Gu F, Parton RG, Gruenberg J. An endosomal beta COP is involved in the pH-dependent formation of transport vesicles destined for late endosomes. J Cell Biol. 1996 Apr;133(1):29-41. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Razi M, Chan EY, Tooze SA. Early endosomes and endosomal coatomer are required for autophagy. J Cell Biol. 2009 Apr 20;185(2):305-21. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
- Styers ML, O’Connor AK, Grabski R, Cormet-Boyaka E, Sztul E. Depletion of beta-COP reveals a role for COP-I in compartmentalization of secretory compartments and in biosynthetic transport of caveolin-1. Am J Physiol Cell Physiol. 2008 Jun;294(6):C1485-98. PubMed, CrossRef
- Kurnikov IV, Kyrychenko A, Flores-Canales JC, Rodnin MV, Simakov N, Vargas-Uribe M, Posokhov YO, Kurnikova M, Ladokhin AS. pH-triggered conformational switching of the diphtheria toxin T-domain: the roles of N-terminal histidines. J Mol Biol. 2013 Aug 9;425(15):2752-64. PubMed, PubMedCentral, CrossRef
